80% slevy na Black Friday. Hosting již za 19 Kč, ZDARMA doména. 

Jan Dvořák

Publikováno 29. října 2026

Fakturační program: který vybrat pro OSVČ a e-shop

Eshopy

7 min

Jan Dvořák

Publikováno 29. října 2026

Další štítkyOnline podnikání
fakturacni program

Stručné shrnutí: Pro většinu freelancerů stačí na začátek bezplatná verze Fakturoidu, iDokladu, SuperFaktury nebo Vyfakturuj, všechny fungují pro pět odběratelů. Placené tarify začínají zhruba na 130 až 190 korunách měsíčně. Rozhodujte podle toho, jestli potřebujete párování plateb s bankou a napojení na e-shop.

Fakturu jde vystavit i ve Wordu. Jenže pak ručně dohledáváte údaje klienta, hlídáte, kdo zaplatil, a na konci roku sčítáte příjmy v tabulce. Fakturační program tohle všechno udělá za vás a nejlevnější z nich jsou zdarma. Projdeme si, co by měl umět, jak se liší nejpoužívanější programy a na co se dívat, pokud fakturujete z e-shopu.

Obsah

Co by měl fakturační program umět

  1. Vyplnit údaje podle IČO. Zadáte IČO klienta a program si název a adresu stáhne sám z registru ARES, kde jsou údaje o firmách i živnostnících na jednom místě.
  2. QR platbu na faktuře. Klient fakturu zaplatí naskenováním kódu v mobilním bankovnictví, bez přepisování čísla účtu a variabilního symbolu.
  3. Párovat platby s bankou. Program se napojí na váš účet a sám pozná, které faktury jsou zaplacené. Odpadne ruční kontrola výpisů.
  4. Posílat upomínky. Když faktura není zaplacená do splatnosti, program klientovi automaticky připomene platbu.
  5. Opakované faktury. Pokud fakturujete stejnému klientovi každý měsíc stejnou částku, program fakturu vystaví a odešle sám.
  6. Export pro daňové přiznání a účetní. Na konci roku si stáhnete přehled příjmů a nemusíte nic sčítat.
  7. Přehledy a statistiky. Kolik jste za měsíc vyfakturovali, kolik vám klienti dluží a kteří klienti vám přinášejí nejvíc. Některé programy průběžně počítají i odhad daně a odvodů na sociální a zdravotní pojištění, takže vás na konci roku nic nepřekvapí.
  8. Mobilní aplikaci. Fakturu vystavíte i z telefonu, třeba hned po skončení zakázky.

Ne všechno je ale v bezplatné verzi. Párování plateb, upomínky a opakované faktury bývají až v placených tarifech, a často až ve vyšších.

Srovnání fakturačních programů

Všechny čtyři programy mají trvale bezplatnou verzi se stejným limitem: fakturovat můžete nejvýš pěti odběratelům. Placená verze se vyplatí, až budete mít víc klientů nebo budete chtít automatizaci.

V detailech se bezplatné verze liší. Fakturoid i SuperFaktura vystaví zdarma neomezeně faktur a mají mobilní aplikaci, Fakturoid navíc s QR platbou. A údaje z přijatých faktur a účtenek vám AI zdarma přečte a přepíše do programu třikrát v iDokladu a dvacetkrát měsíčně v SuperFaktuře.

Srovnání placených tarifů

Program Cena od Co přidává placená verze Pro koho se hodí
Fakturoid 151 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě Neomezeně odběratelů a průběžný výpočet daně a odvodů, opakované faktury až v tarifu Na maximum za 393 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě Freelanceři a služby, nejrozšířenější česká online fakturace
iDoklad 187 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě Neomezený adresář, párování plateb a napojení přes API až v tarifu Oblíbený za 358 Kč měsíčně bez DPH při roční platbě Firmy, které chtějí víc funkcí na jednom místě, včetně skladu
SuperFaktura 129 Kč měsíčně bez DPH Už v nejlevnějším tarifu neomezeně kontaktů, párování plateb a sklad, upomínky a automatické pravidelné faktury od tarifu Standardní za 279 Kč měsíčně bez DPH Kdo chce párování plateb co nejlevněji nebo fakturuje do zahraničí, doklady umí ve čtrnácti jazycích
Vyfakturuj 175 Kč měsíčně bez DPH Neomezená fakturace už v nejlevnějším tarifu, pravidelné faktury a napojení na sedm platebních bran od tarifu Ideal za 299 Kč měsíčně bez DPH Kdo chce, aby klienti mohli fakturu zaplatit rovnou online

Všechny čtyři si můžete vyzkoušet v plné verzi zdarma, Fakturoid, SuperFakturu a Vyfakturuj 30 dní, iDoklad 60 dní.

Ceny se u fakturačních programů mění zhruba jednou za rok a liší se podle délky předplatného. Před rozhodnutím si je proto ověřte přímo na webu programu.

Který vybrat podle vaší situace

Začínáte a fakturujete pár klientům? Bezplatná verze kteréhokoliv z programů vám bude stačit. Limit pěti odběratelů platí pro počet klientů, ne faktur, takže když fakturujete pořád stejným lidem, můžete zůstat zdarma dlouho. A pokud chcete placenou verzi rovnou od začátku, Vyfakturuj dává podnikatelům s IČO mladším než dva roky slevu 80 procent na první roční tarif. Nejlevnější tarif Mini pak vyjde na 420 korun bez DPH za celý rok.

Máte víc klientů a nechcete hlídat platby? Přejděte na placený tarif s párováním plateb. Ušetří vám čas, který byste jinak strávili kontrolou výpisů, a rychle se zaplatí.

Fakturujete každý měsíc stejným klientům? Zaměřte se na opakované faktury. Fakturoid je má až v nejvyšším tarifu, SuperFaktura od tarifu Standardní a Vyfakturuj od tarifu Ideal.

Chcete, aby klienti platili fakturu online? Vyfakturuj se od tarifu Ideal napojí na sedm platebních bran, takže klient může fakturu zaplatit kartou hned po otevření.

Fakturujete do zahraničí? SuperFaktura vystaví doklady ve čtrnácti jazycích, což se hodí, pokud pracujete pro klienty ze zahraničí.

Vedete účetnictví, nebo ho za vás vede účetní? Zeptejte se účetní, s jakým programem pracuje a v jakém formátu chce doklady. Ušetříte si převádění dat. Pokud vedete účetnictví sami, zvažte rovnou účetní program, který umí i fakturaci.

K nejrozšířenějším účetním programům u nás patří POHODA a Money S3. Obě mají bezplatnou verzi s omezeným počtem záznamů a POHODA i online variantu mPOHODA, se kterou pracujete v prohlížeči. Pro větší firmy s víc uživateli se hodí ABRA Flexi. Než si vyberete, zeptejte se účetní, se kterým programem pracuje.

Fakturace z e-shopu

U e-shopu dává smysl, aby se faktura vystavila sama hned po objednávce. K tomu potřebujete napojit e-shop na fakturační program.

  • Shoptet se na Fakturoid napojuje přes externí doplněk, který se platí zvlášť. Faktury se pak vystavují automaticky k objednávkám a ukládají se i kontakty zákazníků.
  • WooCommerce napojíte na Fakturoid i iDoklad přes pluginy, které vyvíjejí čeští autoři, například Toret.
  • Pozor na tarif. Napojení obvykle vyžaduje placenou verzi fakturačního programu. U iDokladu například až tarif s rozhraním API, tedy Oblíbený nebo Prémiový.

Jak e-shop na WooCommerce postavit, rozebírá článek WooCommerce návod. Pokud teprve vybíráte platformu, pomůže srovnání WooCommerce vs. Shoptet vs. PrestaShop.

Co musí faktura obsahovat

Fakturační program povinné údaje vyplní za vás, je ale dobré vědět, co na faktuře být musí.

U neplátce DPH jsou to hlavně údaje o vás i o odběrateli včetně IČO, číslo faktury, datum vystavení, popis toho, co fakturujete, a částka. Plátce DPH musí navíc uvést DIČ, datum uskutečnění zdanitelného plnění, základ daně, sazbu a výši DPH.

Povinné údaje o podnikateli platí i pro váš web. Které to jsou, rozebírá článek Stránka s kontakty. A když klient fakturu nezaplatí, co vám ze zákona náleží, najdete v článku Smlouva s klientem.

Co si z článku odnést

  • Fakturoid, iDoklad, SuperFaktura i Vyfakturuj mají bezplatnou verzi pro pět odběratelů nebo kontaktů.
  • Placené tarify začínají zhruba na 130 až 190 korunách měsíčně.
  • Limit pěti odběratelů se týká počtu klientů, ne faktur.
  • Párování plateb, upomínky a opakované faktury bývají až v placených tarifech.
  • Napojení na e-shop obvykle vyžaduje placenou verzi a doplněk nebo plugin.

Stojí za přečtení

Časté otázky

Jaký je nejlepší fakturační program zdarma?

Fakturoid, iDoklad, SuperFaktura i Vyfakturuj mají trvale bezplatnou verzi. Fakturoid umožňuje zdarma neomezený počet faktur pěti odběratelům, iDoklad a SuperFaktura mají limit pět kontaktů a Vyfakturuj pět odběratelů nebo dodavatelů. Pro začínajícího freelancera stačí kterýkoliv z nich.

Kolik stojí fakturační program?

Placené tarify začínají zhruba na 130 až 190 korunách měsíčně, SuperFaktura od 129 Kč, Fakturoid od 151 Kč bez DPH při roční platbě, Vyfakturuj od 175 Kč a iDoklad od 187 Kč při roční platbě. Začínající podnikatelé s IČO mladším než dva roky dostanou u Vyfakturuj na první rok slevu 80 procent. Vyšší tarify s párováním plateb a dalšími funkcemi stojí víc.

Můžu fakturovat zdarma?

Ano. Bezplatné verze fakturačních programů vám umožní vystavovat faktury bez poplatku, jen s omezeným počtem odběratelů nebo kontaktů, nejčastěji pěti.

Jak napojit fakturační program na e-shop?

Přes doplněk nebo plugin. Shoptet se napojuje na Fakturoid externím doplňkem, WooCommerce na Fakturoid i iDoklad pluginy od českých vývojářů. Napojení obvykle vyžaduje placenou verzi fakturačního programu.

Co musí obsahovat faktura od neplátce DPH?

Údaje o dodavateli i odběrateli včetně IČO, číslo faktury, datum vystavení, popis fakturovaného plnění a částku. Fakturační program je vyplní za vás.

Potřebuju fakturační program, nebo účetní program?

Pokud jen vystavujete faktury a daňovou evidenci za vás řeší účetní, stačí fakturační program. Pokud vedete účetnictví sami, vyplatí se účetní program, který fakturaci umí také.

Jan Dvořák

Ve Webglobe mám na starosti blog, weby, SEO a GEO a vymýšlím i kreativní kampaně. Protože pracuju v hostingové firmě, vidím z první ruky, na čem lidé s weby nejčastěji ztroskotají, a právě o tom píšu. Za ta léta z toho vzniklo přes 500 článků, případových studií a e-booků. Pokud řešíte online marketing, viditelnost v Googlu a AI vyhledávačích nebo web na WordPressu, najdete v nich odpovědi z praxe.

Více mých článků

Zapište se do našeho newsletteru Přihlásili jste se k odběru novinek

Nechte si od nás posílat zajímavé nabídky, novinky a články. Váš email byl úspěšně přidán.
Pole je povinné se správným email formátem